Пцр тест системы для определения золотистого стафилококка. Все про анализ на стафилококк

Метициллинрезистентные Staphylococcus aureus - возбудители внутрибольничных инфекций: идентификация и генотипирование

РАЗРАБОТАНЫ: Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Г.Ф.Лазикова, А.А.Мельникова, Н.В.Фролова); Государственным учреждением "Научно-исследовательский институт микробиологии и эпидемиологии им.Н.Ф.Гамалеи РАМН" г.Москва (О.А.Дмитренко, В.Я.Прохоров., академик РАМН A.Л.Гинцбург).


УТВЕРЖДАЮ

Заместитель Руководителя Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека Л.П.Гульченко 23 июля 2006 г.

1. Область применения

1. Область применения

1.1. В настоящих методических указаниях представлена информация о роли метициллинрезистентных штаммов золотистого стафилококка в возникновении внутрибольничных инфекций, их микробиологических и эпидемиологических особенностях, изложены традиционные и молекулярно-генетические методы идентификации и типирования.

1.2. Методические рекомендации разработаны в помощь специалистам органов и учреждений, осуществляющих государственный санитарно-эпидемиологический надзор, и лечебно-профилактических учреждений, осуществляющих организацию и проведение профилактических и противоэпидемических мероприятий по борьбе с внутрибольничными инфекциями.

2. Нормативные ссылки

2.1. Федеральный закон "О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения" N 52-ФЗ от 30 марта 1999 г . (с изменениями от 30 декабря 2001 г., 10 января, 30 июня 2003 г., 22 августа 2004 г.)

2.2. Положение о государственной санитарно-эпидемиологической службе Российской Федерации , утвержденное постановлением Правительства Российской Федерации N 554 от 24 июля 2000 г .

2.3. Постановление N 3 от 05.10.2004 г. "О состоянии заболеваемости внутрибольничными инфекционными болезнями и мерах по их снижению" .

2.4. Методические указания МУ 3.5.5.1034-01 * "Обеззараживание исследуемого материала, инфицированного бактериями I-IV групп патогенности, при работе методом ПЦР".
________________
* На территории Российской Федерации документ не действует. Действуют МУ 1.3.2569-09 . - Примечание изготовителя базы данных.

2.5. Методические указания МУК 4.2.1890-04 "Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам".

2.6. Методические указания по эпидемиологическому надзору за внутрибольничными инфекциями от 02.09.87. N 28-6/34.

3. Общие сведения

В последнее десятилетие проблема внутрибольничных инфекций (ВБИ) приобрела исключительно большое значение для всех стран мира. Это обусловлено, прежде всего, значительным ростом числа госпитальных штаммов микроорганизмов, обладающих устойчивостью к широкому кругу антимикробных препаратов. Несмотря на значительный недоучет, в Российской Федерации ежегодно регистрируется около 30 тыс. случаев внутрибольничных инфекций, при этом минимальный экономический ущерб составляет более 5 млрд. рублей ежегодно. Среди возбудителей ВБИ одно из первых мест, по-прежнему, принадлежит микроорганизмам рода Staphylococcus , наиболее патогенным представителем которого является S.aureus. Эпидемиологическая ситуация осложняется в связи с широким распространением в стационарах, а также появлением и во внебольничной среде, клинических изолятов S.aureus , устойчивых к оксациллину (ORSA или MRSA). MRSA способны вызывать разнообразные клинические формы внутрибольничных инфекций, включая наиболее тяжелые, такие, как: бактериемия, пневмония, синдром септического шока, септический артрит, остеомиелит и другие, которые требуют длительного и дорогостоящего лечения. Появление осложнений, вызванных MRSA, приводит к увеличению сроков госпитализации, показателей летальности, значительным экономическим потерям. Показано, что рост частоты ВБИ, наблюдаемый в стационарах различных стран мира, обусловлен распространением эпидемических штаммов MRSA, многие из которых способны вырабатывать пирогенные токсины - суперантигены, подавляющие иммунный ответ на S.aureus .

С конца 90-х годов прошлого века в стационарах России отмечается рост частоты выделения MRSA, которая в ряде больниц достигла 30-70%. Это делает неэффективным использование многих антимикробных препаратов и существенно ухудшает качество оказания медицинской помощи населению. В этих условиях совершенствование методов эпидемиологического и микробиологического мониторингов, направленных на выявление эпидемически значимых штаммов, приобретает все более актуальное значение.

4. Характеристика MRSA как возбудителей внутрибольничных инфекций

4.1. Таксономия и биологические особенности

В последние годы отчетливо прослеживается тенденция роста ВБИ, вызванных условно-патогенными грамположительными микроорганизмами и, в частности, представителями рода Staphylococcus . Согласно 9 изданию "Определителя бактерий Берджи" (1997) стафилококки отнесены к группе грамположительных факультативно анаэробных кокков вместе с родами Aerococcus, Enterococcus, Gemella, Lactococcus, Leuconostoc, Melissococcus, Pediococcus, Saccharococcus, Stomatococcus, Streptococcus, Trichococcus и Vagococcus . От других представителей этой группы стафилококков отличает совокупность свойств, включающая характерное, в виде виноградной грозди, взаиморасположение микробных клеток в культуре, способность к росту в температурном интервале от 6,5 до 45 °С, при рН среды в пределах 4,2-9,3, в присутствии повышенных концентраций NaCl (до 15%) и 40% желчи. Стафилококки обладают выраженной биохимической активностью. Они каталазоположительные, восстанавливают нитрат до нитрита или газообразного азота, гидролизуют белки, гиппурат, жиры, твины, расщепляют большое число углеводов в аэробных условиях с образованием уксусной кислоты и незначительных количеств СO, однако эскулин и крахмал, как правило, не гидролизуют, индол не образуют. При культивировании в аэробных условиях они нуждаются в аминокислотах и витаминах, в анаэробных - требуют дополнительно урацил и ферментируемые источники углерода. Клеточная стенка содержит два главных компонента - пептидогликан и связанные с ним тейхоевые кислоты. В состав пептидогликана входят гликан, построенный из повторяющихся единиц: остатков N-ацетилглюкозамина и N-ацетилмурамовой кислоты, к последней в свою очередь присоединены пептидные субъединицы, состоящие из остатков N (L-аланин-D-изоглутамил) -L-лизил-D-аланина. Пептидные субъединицы сшиты пентапептидными мостиками, состоящими исключительно или главным образом из глицина. В отличие от других грамположительных факультативно анаэробных кокков стафилококки чувствительны к действию лизостафина - эндопептидазы, гидролизующей глицил-глициновые связи в межпептидных мостиках пептидогликана, но устойчивы к действию лизоцима. Содержание гуанидина+цитозина в структуре ДНК Staphylococcus на уровне 30-39% свидетельствует о филогенетической близости к родам Enterococcus, Bacillus, Listeria и Planococcus . Род Staphylococcus насчитывает 29 видов, наиболее патогенным среди них как для человека, так и для многих млекопитающих, является вид Staphylococcus aureus . Это объясняется способностью представителей данного вида продуцировать большое количество экстрацеллюлярных продуктов, к числу которых относятся многочисленные токсины и ферменты, участвующие в колонизации и развитии инфекционного процесса. Почти все штаммы секретируют группу экзопротеинов и цитотоксинов, которая включает 4 гемолизина (альфа, бета, гамма и дельта), нуклеазы, протеазы, липазы, гиалуронидазы и коллагеназы. Основная функция этих ферментов состоит в превращении тканей хозяина в питательный субстрат, необходимый для размножения микроба. Некоторые штаммы продуцируют один или несколько дополнительных экзопротеинов, к их числу относятся токсин синдрома токсического шока, стафилококковые энтеротоксины (А, В, Cn, D, Е, G, Н, I) эксфолиативные токсины (ЕТА и ЕТВ), лейкоцидин. Наиболее известной таксономически значимой характеристикой S.aureus является способность коагулировать плазму крови, которая обусловлена продукцией внеклеточно секретируемого протеина с молекулярной массой около 44 kDa. Путем взаимодействия с протромбином плазмокоагулаза активирует процесс превращения фибриногена в фибрин. Образовавшийся сгусток защищает микробные клетки от действия бактерицидных факторов макроорганизма и обеспечивает благоприятную среду для их размножения. Впоследствии в результате растворения фибринового сгустка размножившиеся микроорганизмы поступают в кровяное русло, что может приводить к развитию генерализованных форм инфекции. В 8-ом издании "Руководства Берджи по определению бактерий" (1974) стафилококки характеризовались как микроорганизмы, обычно чувствительные к антибиотикам, таким, как -лактамовые, макролиды, тетрациклины, новобиоцин и хлорамфеникол, обладающие устойчивостью к полимиксину и полиенам. Это положение было опровергнуто широким распространением сначала пенициллинустойчивых, а впоследствии метициллинрезистентных штаммов. Устойчивый к действию стафилококковой -лактамазы первый полусинтетический пенициллин - метициллин предназначался для лечения инфекций, вызванных пенициллинрезистентными штаммами. Однако менее чем через два года после его введения в лечебную практику в 1961 г. появились первые сообщения о выделении метициллинрезистетных штаммов золотистого стафилококка (MRSA). Они стали проблемой для специалистов только к середине 70-х - началу 80-х годов прошлого века, когда стало очевидным, что обладая всеми характерными морфологическими, культуральными, физиологическими и биохимическими свойствами, характерными для золотистого стафилококка, MRSA имеют свои биологические особенности. Во-первых, уникальный биохимический механизм резистентности к метициллину обеспечивает им устойчивость ко всем полусинтетическим пенициллинам и цефалоспоринам. Во-вторых, такие штаммы способны "аккумулировать" гены антибиотикорезистентности и поэтому нередко обладают устойчивостью к нескольким классам антимикробных препаратов одновременно, тем самым значительно затрудняя лечение пациентов. И, наконец, в-третьих, такие штаммы способны к эпидемическому распространению, вызывают тяжелые формы внутрибольничных инфекций. Несмотря на то, что в последующие годы метициллин был заменен на оксациллин или диклоксациллин, термин MRSA прочно закрепился в научной литературе.

4.2. Клиническое значение

В настоящее время MRSA являются ведущими возбудителями внутрибольничных инфекций в стационарах многих странах мира. Частота их выделения в стационарах США, Японии, многих стран Западной Европы достигает 40-70%. Исключение составляют, по-видимому, только ряд скандинавских стран, где исторически были приняты жесткие противоэпидемические меры по контролю за распространением таких штаммов. В стационарах Российской Федерации частота выделения MRSA колеблется от 0 до 89%. Наибольшая частота выделения отмечается в реанимационных, ожоговых, травматологических и хирургических отделениях стационаров, расположенных в крупных городах. Одной из основных причин этой закономерности является концентрация в таких стационарах пациентов с нарушениями целостности кожных покровов и поврежденными иммунологическими барьерами. Наиболее частым местом локализации инфекции являются послеоперационные и ожоговые раны и дыхательные пути. Первичные и вторичные бактериемии наблюдаются примерно у 20% инфицированных больных. В случае инфицирования ожоговых больных частота бактериемий нередко возрастает до 50%. Факторами, способствующими развитию бактериемии, является присутствие центрального венозного катетера, анемия, гипотермия и назальное носительство. Развитие бактериемии значительно увеличивает вероятность летального исхода. Особенно высокая смертность, обусловленная бактериемией, наблюдается среди пациентов, находящихся в ожоговых и отделениях интенсивной терапии, где она может достигать 50% по сравнению с 15% в контрольной группе. Риск развития летального исхода возрастает почти в три раза среди пациентов, у которых бактериемия обусловлена MRSA, по сравнению с пациентами, инфицированными метициллинчувствительными штаммами S.aureus . Развитие госпитальной бактериемии приводит к значительному увеличению стоимости госпитализации. В современных условиях лечение таких пациентов требует, как правило, внутривенного введения ванкомицина, тейкопланина или линезолида, однако клиническая эффективность этих препаратов нередко оказывается значительно ниже, чем у антибиотиков, используемых для лечения пациентов с осложнениями, вызванными метициллинчувствительными S.aureus . По данным Центра по контролю за заболеваниями (США), средняя продолжительность пребывания пациента в больнице в случае хирургического вмешательства составляет 6,1 дня, тогда как при возникновении осложнений, вызванных MRSA, она увеличивается до 29,1 дня, при этом средние расходы возрастают с 29455$ до 92363$ в пересчете на каждый случай.

Заболевания, вызванные MRSA, могут начинаться на фоне терапии антибиотиками, в том числе аминогликозидами и цефалоспоринами. В этой связи необходимо отметить, что неадекватное назначение антибиотиков в случае тяжелых ВБИ драматически ухудшает прогноз заболевания. Летальность при осложнениях, вызванных MRSA, значительно колеблется и зависит как от возраста пациента, сопутствующего заболевания (артериальная гипертензия, диабет и др.), так и от присоединения дополнительной микрофлоры. Наиболее распространенными вторичными проявлениями инфекции, обусловленной MRSA, являются эндокардиты, гематогенный остеомиелит, септический артрит. Одним из наиболее грозных осложнений, вызываемых MRSA, является синдром токсического шока (СТШ). Клинические проявления СТШ включают следующий симптомокомплекс: гипертермия, сыпь, рвота, диарея, гипотензия, генерализованный отек, острый респираторный дистресс синдром, полиорганная недостаточность, диссеминированная интраваскулярная коагуляция. СТШ может развиться как осложнение после родов, хирургических вмешательств, при суперинфицировании S.aureus трахеальных повреждений, вызванных вирусом гриппа. Недавно описанные стафилококковая скарлатина и синдром упорной десквамации эпителия рассматривают как варианты СТШ.

4.3. Факторы патогенности и вирулентность

Многие эпидемические штаммы MRSA продуцируют пирогенные токсины, обладающие суперантигенной активностью (PTSAgs), к числу которых принадлежат энтеротоксины А, В, С и токсин синдрома токсического шока (TSST-1). Взаимодействуя с вариабельной областью -цепи рецепторов Т-клеток PTSAgs активируют значительную популяцию (10-50%) Т-лимфоцитов, что приводит к выбросу большого количества цитокинов. Суперантигены способны разрушать эндотелиальные клетки и могут элиминировать нейтрофилы из очагов воспаления. Они являются причиной или осложняют патогенез острых и хронических заболеваний человека, таких, как септический шок, сепсис, септические артриты, гломерулонефрит и некоторых других. Неменструальный синдром токсического шока может быть ассоциирован не только со штаммами-продуцентами TSST-1, но и со штаммами, продуцирующими энтеротоксины А, В и С. Следует иметь в виду, что распознавание постхирургического токсического шока нередко бывает затруднено вследствие отсутствия характерных для золотистого стафилококка признаков нагноения в области хирургической раны. Отмечена корреляция между сенсибилизацией стафилококковыми энтеротоксинами А и В и тяжестью течения таких заболеваний, как аллергический ринит, атопический дерматит, бронхиальная астма, реактивные артриты. Гены, детерминирующие синтез PTSAgs, могут находиться на мобильных генетических элементах (бактериофагах "островах патогенности") в составе хромосомы MRSA.

Вопрос о вирулентности MRSA остается дискутабельным. Они практически не вызывают заболевания у здоровых лиц из числа медицинского персонала. Вместе с тем в многочисленных исследованиях показано, что прогноз при тяжелых формах внутрибольничных инфекций, таких, как пневмония и бактериемия, значительно хуже среди пациентов, инфицированных MRSA, по сравнению с пациентами, инфицированными метициллинчувствительными S.aureus .

4.4. Генетический контроль устойчивости к метициллину и особенности фенотипической экспрессии

Мишенью действия -лактамных антибиотиков (как пенициллинов, так и цефалоспоринов) являются транс- и карбоксипептидазы - ферменты, участвующие в биосинтезе основного компонента клеточной стенки микроорганизмов - пептидогликана. Благодаря своей способности связываться с пенициллином и другими -лактамами данные ферменты получили название пенициллинсвязывающих белков (ПСБ). У Staphylococcus aureus имеются 4 ПСБ, отличающиеся как по молекулярной массе, так и по функциональной активности. Устойчивость метициллинрезистентных штаммов золотистого стафилококка (MRSA) к -лактамным антибиотикам обусловлена продукцией дополнительного пенициллинсвязывающего протеина - ПСБ-2", отсутствующего у чувствительных микроорганизмов. При подавлении -лактамным антибиотиком активности основных пенициллинсвязывающих белков ПСБ-2", в силу своего более низкого сродства к препаратам данной группы, продолжает функционировать и сохраняет микробной клетке жизнеспособность. Синтез ПСБ-2" кодируется геном mec А, расположенным на хромосоме S.aureus , в специфической области, обнаруживаемой только у метициллинрезистетных штаммов стафилококка - mec ДНК. Мес ДНК представляет новый класс мобильных генетических элементов, который получил название стафилококковая хромосомная кассета mec (Staphylococcal chromosomal cassette mec =SCCmec ). Выявлено существование 4 типов SCСmec , различающихся как размерами (от 21 до 66 т.п.н.), так и набором генов, составляющих данные кассеты. Разделение на типы основано на различиях в генах, образующих собственно комлекс mec , и в наборе генов, кодирующих рекомбиназы ccrА и ccrВ , входящих в различных сочетаниях в стафилококковую хромосомную кассету (рис.1). Комлекс mec может включать: mecА - структурный ген, детерминирующий синтез ПСБ-2"; me mecА ; mecR1 - ген, передающий внутрь клетки сигнал о наличии в среде -лактамного антибиотика; а также инсерционные последовательности IS43 1 и IS1272 . В настоящее время известны 4 варианта комплекса mec (рис.2).

Рис.1. Типы SCCmec

Характеристика типов SCC mec

Тип SCCmec

Размер (т.п.н.)

Класс mec

B+область J1a

B+область J1b

Рис.1. Типы SCCmec

Рис.2. Генетическая структура комплексов mec различных классов

Генетическая структура комплексов mec различных классов

Класс A, IS431 - mec A-mec R1-mec 1

- Класс В, IS431 - mec A-mec R1-IS1272

- Класс С, IS431 - mec A-mec R1-IS431

- Класс D, IS431 - mec A-mec R1

Рис.2. mecА - структурный ген, детерминирующий синтез ПСБ-2"; me cI - регуляторный ген, влияющий на транскрипцию mecА ;
mecR1 - ген, передающий внутрь клетки сигнал о наличии в среде -лактамного антибиотика; IS 431 и IS 1272 - инсерционные последовательности


Кроме того, различия между типами кассет mec обусловлены присутствием ряда дополнительных генов, расположенных в генетических областях J1a, J1b.

Уникальность метициллинрезистентности заключается также и в существовании феномена гетерорезистентности, суть которого состоит в том, что в условиях инкубации при 37 °С не все клетки популяции проявляют устойчивость к оксациллину. Генетический контроль феномена гетерорезистентности до настоящего времени полностью не выяснен. Известно только, что на экспрессию устойчивости могут влиять регуляторные гены -лактамазы, а также ряд дополнительных генов, так называемые fem (factors essential for methicillin resistance) или aux, локализованные в различных частях хромосомы S.aureus , вне SCCmec . Сложность регуляции проявляется в фенотипических различиях. Выделяют 4 стабильных фенотипа (класса) резистентности. Первые три класса являются гетерогенными. Это означает, что в популяциях стафилококков, относящихся к этим классам, присутствуют субпопуляции микробных клеток с разным уровнем резистентности. При этом клоны стафилококков, получаемые из изолированных колоний (образовавшихся при рассеве первичной культуры) по популяционному составу полностью совпадают с исходной культурой.

Класс 1. Рост 99,99% клеток подавляется оксациллином в концентрации 1,5-2 мкг/мл, рост 0,01% микробов подавляется только при 25,0 мкг/мл.

Класс 2. Рост 99,9% клеток подавляется при концентрации оксациллина 6,0-12,0 мкг/мл, тогда как рост 0,1% микробов подавляется при концентрации >25,0 мкг/мл.

Класс 3. Рост 99,0-99,9% клеток подавляется при концентрации 50,0-200,0 мкг/мл и только рост 0,1-1% микробной популяции подавляется при концентрации оксациллина 400,0 мкг/мл.

Класс 4. Представители этого класса характеризуются гомогенным уровнем устойчивости, который превышает 400,0 мкг/мл для всей популяции.

В связи с наличием гетерогенности по устойчивости к оксациллину могут возникать трудности при идентификации MRSA традиционными микробиологическими методами.

4.5. Особенности эпидемиологии MRSA

С помощью различных молекулярно-генетических методов типирования установлено, что глобальное распространение MRSA носит эпидемический характер. В отличие от метициллинчувствительных S.aureus , подавляющее большинство клинических изолятов MRSA принадлежат к ограниченному числу генетических линий или клонов. Выявленные в разных стационарах различными группами исследователей они первоначально получили и разные названия (табл.1). Так, эпидемические штаммы EMRSA1-EMRSA-16 были впервые идентифицированы английскими исследователями, а эпидемические клоны: Иберийский, Бразильский, Японо-Американский, педиатрический - группой американских исследователей под руководством G. de Lencastre. Следует иметь в виду, что четкой градации между понятиями эпидемический штамм и эпидемический клон не существует. Согласно обычно используемой терминологии, эпидемическим считается штамм, вызвавший три и более случая заболеваний среди пациентов нескольких стационаров. Эпидемический клон - это эпидемический штамм, распространившийся в стационарах стран различных континентов. Вместе с тем многие из первоначально идентифицированных в Великобритании эпидемических штаммов стали фактически эпидемическими клонами в силу своего широкого географического распространения. Использование для типирования метода секвенирования внутренних фрагментов 7 "housekeeping" генов, т.е. генов, ответственных за поддержание жизнедеятельности микробной клетки (метод мультилокусного секвенирования), позволило установить принадлежность этих многочисленных клонов всего лишь к 5 филогенетическим линиям или клональным комплексам: СС5, СС8, СС22, СС30, СС45. Внутри клональных комплексов возможно подразделение на группы или сиквенс-типы, которые различаются 1-3 мутациями или рекомбинациями в структуре секвенированных генов. Установлена довольно жесткая взаимосвязь между принадлежностью MRSA к определенному генетическому "бэкграунду" и содержанием определенного типа mec ДНК. Наиболее диверсифицированными и многочисленными являются клональные комлексы СС5 и СС8, которые содержат эпидемические клоны с различными типами SССmec . В то же время SCCmec типа IV может присутствовать в различных "бэкграундах". Особенно многочисленной является группа St239, которая представляет отдельную ветвь внутри клонального комплекса СС8. Эта группа включает различные эпидемические штаммы и клоны: EMRSA-1, -4, -7, -9, -11, Бразильский, Португальский (табл.1). В настоящее время в стационарах России выявлено эпидемическое распространение штаммов MRSA, генетически родственных EMRSA-1 (Бразильскому клону) и Иберийскому клону.

Таблица 1

Основные эпидемические штаммы и клоны MRSA

Эпидемические штаммы, иденти-
фицированные в CPHL* (г.Лондон)

Молекулярно-генетические характеристики

Международные клоны, идентифици-
рованные в LMMRU** (г.Нью-Йорк)

Страна распространения

Клональный комплекс

Сиквенс тип

Тип SCCmec

Португальский, Бразильский

Великобритания, США, Финляндия, Германия, Польша, Швеция, Греция, Словения

EMRSA-2, -6, -12,
-13, -14

Великобритания, США, Германия, Франция, Нидерланды

Иберийский

Великобритания, США, Финляндия, Германия, Португалия, Швеция, Словения

Великобритания, США

Японо-
Американский

Великобритания, США, Япония, Финляндия, Ирландия

Педиатрический

Великобритания, США, Португалия, Франция, Польша

Великобритания, Германия, Швеция, Ирландия

Великобритания, США, Финляндия

Германия, Финляндия, Швеция, Бельгия

Примечание: * - Центральная лаборатория здравоохранения;

** - Лаборатория молекулярной микробиологии Рокфеллеровского университета.


Будучи однажды занесенными в стационар, MRSA могут выживать там в течение длительного времени. Это определяет стратегию противоэпидемических мероприятий: очень важно не допустить занос и распространение в стационаре эпидемических штаммов.

Следует отметить, что периодически происходит смена эпидемического штамма, доминирующего на отдельных территориях. Так, по данным стафилококковой референс-лаборатории в Colindale (London), в 1996 г. штаммы EMRSA-15 и EMRSA-16 были ответственны более чем за 1500 инцидентов, охвативших трех и более пациентов, в 309 больницах Англии, тогда как остальные эпидемические штаммы были ответственны только за 361 инцидент в 93 больницах. Распространение этих эпидемических штаммов привело к росту смертности от MRSA в 15, а частоты бактериемии в 24 раза за период с 1993 по 2002 г.г. согласно данным национального департамента статистики Великобритании.

Продолжает нарастать спектр антибиоткорезистентности эпидемических штаммов MRSA. Они гораздо быстрее, чем метициллинчувствительные, приобретают устойчивость к препаратам из группы фторхинолонов. Характерной чертой многих эпидемических штаммов MRSA является устойчивость практически ко всем известным классам антимикробных препаратов, за исключением гликопептидов и оксазолидинонов. В последние годы участились случаи выделения изолятов MRSA, обладающих умеренной чувствительностью к ванкомицину и даже ванкомицинрезистентных. Распространение таких штаммов в стационарах России может иметь драматические последствия.

С проблемой госпитальных штаммов MRSA тесно переплетается и проблема MRSA вне госпитального происхождения. Эти штаммы пока не обладают множественной резистентностью к антибиотикам, генетически отличаются от госпитальных штаммов, их происхождение остается неизвестным. Предполагается, что они сформировались из спорадических госпитальных штаммов. Внегоспитальные штаммы MRSA способны вызывать некротизирующую форму пневмонии, характеризующуюся крайне тяжелым течением и требующую госпитализации пациента, в связи с чем возникает угроза заноса и распространения таких штаммов в стационарах.

Резервуары и источники инфекции

Основным резервуаром и источником инфекции в госпитальной среде являются как инфицированные, так и колонизованные пациенты. Факторами, способствующими инфицированию пациентов MRSA, являются: длительное пребывание в стационаре, неправильное назначение антибиотиков, прием более одного антибиотика, продолжительность антибиотикотерапии более 20 дней. При подозрении на развитие инфекции необходимо проведение микробиологического исследования отделяемого раны, кожных поражений, мест манипуляций, интравенозного катетера, трахеостомы и других видов стом, крови, мокроты, а также мочи у катетеризованных пациентов. В случае возникновения колитов или энтероколитов, ассоциированных с приемом антибиотиков, необходимо проводить исследование кала.

Произошла ошибка

Платеж не был завершен из-за технической ошибки, денежные средства с вашего счета
списаны не были. Попробуйте подождать несколько минут и повторить платеж еще раз.

Стафилококки хорошо известны как возбудители гнойно-септических инфекций у человека и животных. Наряду с представителями семейства Enterobacteriaceae они занимают ведущее место в этиологии гнойных заболеваний. Род Staphylococcus включает в себя 35 различных видов. В зависимости от способности продуцировать коагулазу, фермент, вызывающий коагуляцию плазмы крови, они подразделяются на две группы: коагулазопозитивные и коагулазонегативные. Место обитания стафилококков – человек и теплокровных животные, внешняя среда. Локализация у человека – кожа и слизистые оболочки, толстый кишечник. Источником стафилококковых инфекций является больной человек или здоровый носитель. Пути передачи: воздушно-капельный, воздушно-пылевой, контактный, пищевой. Восприимчивость к инфекции зависит от общего состояния организма и возраста. Наиболее восприимчивы дети, особенно новорожденные и грудного возраста. В норме способность стафилококка к инвазии и резистентность хозяина хорошо сбалансированы, поэтому инфекция не развивается, пока не создастся ситуация, когда встречаются высоковирулентный микроорганизм или макроорганизм со сниженной резистентностью.

Наиболее известным представителем коагулазопозитивных стафилококков является S.aureus (золотистый стафилококк). Он встречается в передних отделах носовых ходов у 20–40% здоровых взрослых людей. Приблизительно у 1/3 населения он постоянно выделяется из носа, у 1/3 отмечается транзиторное носительство и 1/3 свободна от носительства. S.aureus наиболее часто выделяется при гнойной патологии, вызывает целый ряд заболеваний: фолликулиты, фурункулы и карбункулы, гидроадениты, маститы, раневые инфекции, бактериемии и эндокардиты, менингиты, перикардиты, легочные инфекции, остеомиелиты и артриты, гнойные миозиты, пищевые отравления, синдром токсического шока. Упомянутые заболевания обусловливаются факторами патогенности: капсульными полисахаридами, пептидогликанами и тейхоевыми кислотами, протеином А, ферментами, гемолизинами, токсинами (эксфолиативный, энтеротоксины от А до Е, Н и I), суперантигеном, который принадлежит к энтеротоксину (TSST-1), вызывающему токсический шок синдром.

Все остальные коагулазопозитивные стафилококки выделяются в основном от животных и редко от человека, но в отдельных случаях могут вызывать у человека гнойно-воспалительные заболевания.

Среди коагулазонегативных стафилококков наиболее значимы в патологии человека S.epidermidis и S.saprophyticus . Они могут вызывать инфекции мочевыводящих путей, остеомиелиты, бактериемии, инфекции у новорожденных детей в палатах интенсивной терапии, заболевания глаз, кожные инфекции, поражают клапаны сердца, вызывают гнойные воспаления при операции по замене сердечных клапанов на искусственные, при шунтирование органов, использование внутривенных катетеров, катетеров при гемодиализе, а также при ангиопластике.

В настоящее время микроорганизмы рода Staphylococcus играют лидирующую роль среди возбудителей внутрибольничных инфекций. До определенного времени пенициллин был основным препаратом выбора при лечении тяжелых гнойных инфекций вызываемых S.aureus . Затем стали появляться штаммы устойчивые к этому антибиотику. Оказалось, что устойчивость к пенициллину была обусловлена продукцией фермента.-лактамазы разрушающей β-лактамное кольцо в молекуле пенициллина. В настоящее время около 80% изолируемых штаммов S.aureus синтезируют β-лактамазу. Вместо пенициллина в случае выделения пенициллин резистентных штаммов применяют полусинтетические пенициллины устойчивые к β-лактамазе. Но с 80-х годов начинают выделяться штаммы S.aureus устойчивые и к этой группе антибиотиков в частности к оксациллину и метициллину. Устойчивость таких штаммов связана с продукцией пенициллин связывающего белка (PBP 2а), синтез которого в свою очередь связан с приобретением стафилококками хромосомного гена mecA. Штаммы S.aureus , обладающие этим геном проявляют устойчивость ко всем β-лактамным антибиотикам включая цефалоспорины. S.aureus с упомянутым механизмом устойчивости присваивается термин метициллин- резистентные штаммы. В ряде случаев устойчивость к полусинтетическим пенициллинам может быть обусловлена гиперпродукцией β-лактамаз. В этом случае устойчивость к полусинтетическим пенициллинам при определении ее в лабораторных условиях характеризуется как умеренная. Метициллин-резистентные штаммы S.aureus часто проявляют устойчивость к другим антибиотикам в частности к эритромицину и клиндамицину. В связи с их распространением в ряде зарубежных стран в качестве антибиотиков выбора начинают использовать ванкомицин и тейкопланин. Но уже в 1996 году появляются первые сообщения о выделении штаммов S.aureus с умеренной устойчивостью к ванкомицину (MIC=8 мкг/ мл.), а с 2002 г. штаммов с высокой устойчивостью (МIC>32 мкг/мл.). Метициллин резистентные штаммы выявляются также среди S.epidermidis, а ванкомицрезистентные среди S.haemolyticus .

Для лечения гнойно-септических инфекций, вызванных стафилококками, в настоящее время широко используются лечебные бактериофаги, как монофаги так и комбинированные, содержащие в своем составе расы фагов лизирующих клетки нескольких видов патогенов. В отличие от антибиотиков они не подавляют рост нормальной симбиотической микрофлоры человека и не приводят к дисбактериозам. Тем не менее, нужно имеет в виду, что фаги также вызывают развитие резистентности у стафилококков, поэтому перед их использованием, как и перед применением антибиотиков, необходимо проверять чувствительность к ним у изолируемых штаммах стафилококков.

Показания к обследованию. Признаки гнойно-септической инфекции, обследование медицинского персонала на носительство.

Материал для исследований. Кровь, СМЖ, гной, раневое отделяемое, грудное молоко, мазки из носа; смывы c медицинского оборудования и инвентаря.

Этиологическая лабораторная диагностика включает выделение возбудителя на питательных средах, выявление его ДНК.

Сравнительная характеристика методов лабораторной диагностики, показания к применению различных лабораторных исследований. Техника выделения возбудителя в настоящее время хорошо отработана. Микроорганизмы довольно устойчивы к факторам внешней среды, поэтому если отобранный биологический материал невозможно сразу использовать для исследования, можно воспользоваться специальными контейнерами и траспортными средами. Подробнее техника отбора и транспортировки биологического материала в клинико- диагностическую лабораторию описана в разделе преаналитические этапы исследования. Для выделения возбудителя, как правило, достаточно 3–4 дня. Исключением является выделение стафилококков из крови. В этом случае успех техники во многом будет зависеть от правильного выбора времени для отбора крови и присутствия в крови пациентов антибактериальных препаратов.

Выявление специфического фрагмента ДНК S.aureus , S.epidermidis , S.haemolyticus , S.saprophyticus методом ПЦР проводят при исследовании различного биологического материала. Результаты выявления ДНК методом ПЦР имеют качественный и количественный формат. Возможно одновременное выявление и количественное определение ДНК метициллинрезистентного S.aureus и метициллинрезистентных коагулазонегативных стафилококков. Данное исследование отличается простотой и воспроизводимостью, что позволяет оптимизировать эпидемиологический надзор за распространением метициллинрезистентных штаммов, значительно снизив время и трудоемкость исследования. Однако, выявление специфического фрагмента ДНК S.aureus , S.epidermidis , S.haemolyticus , S.saprophyticus методом ПЦР не позволяет выявить жизнеспособные микроорганизмы, а также определить у них чувствительность к антибиотикам.

Особенности интерпретации результатов лабораторных исследований. При исследовании стерильного биологического материала (кровь, СМЖ) клиническое значение имеет обнаружение S.aureus в любых концентрациях. В нестерильном биологическом материале клиническое значение имеют только высокие концентрации S.aureus , означающие его ведущую роль в воспалительном процессе.

. Методические указания МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам».

Основные эпидемические штаммы и клоны MRSA

Результаты рестрикции представлены в работе (34).

Наборы праймеров для идентификации типов SCCmec

Тип идентифицируемого элемента

Название праймера

Нуклеотидная последовательность

Размер ампликонов н.п.

Ссr тип I

5¢ -ATT GCC TTG ATA ATA GCC I

TCT-3 ¢

5¢ -AAC СТА TAT CAT CAA TCA GTA CGT-3¢

Ссr тип II

1000

5¢ -TAA AGG CAT CAATGC АСА AAC ACT-3

Ссr тип III

1600

5¢ -AGC TCA AAA GCA AGC AAT AGA AT-3¢

Класс А тес

Генный комплекс тес I

5 ¢ - CAA GTG AAT TGA AAC CGC CT-3¢

5 ¢ - CAA AAG GAC TGG ACT GGA GTC

CAAA-3¢

Класс В тес (IS272 - mec A)

5¢ -AAC GCC ACT CAT AAC ATA AGG AA-3¢

2000

5 ¢ -TAT ACC AA CCC GAC AAC-3 ¢

Подтип IVa

5 ¢ - TTT GAA TGC CCT CCA TGA ATA AAA T-3¢

5¢ -AGA AAA GAT AGA AGT TCG AAA GA-3¢

Подтип IVb

5 ¢ - AGT АСА TTT TAT CTT TGC GTA-3 ¢

1000

5 ¢ - AGT CAC TTC AAT ACG AGA AAG

TA-3 ¢

5.2.5.3 . Идентификация генов, детерминирующих синтез энтеротоксинов A(sea), В(seb), С(sec) и токсина синдрома токсического шока(tst-Н)

Для определения генов sea, seb , sec используется мультиплексная ПЦР.

Состав реакционной смеси стандартный. Концентрация праймеров для определения генов sea - 15 пкм/мкл, seb , sec - 30 пкм/мкл.

Для определения гена tst - H концентрация MgCl 2 в реакционной смеси - 2,0 мМ, концентрация праймеров - 12 пкм/мкл.

Режим амплификации № 1

Наборы праймеров для идентификации генов sea , seb , sec

Олигонуклеотидная последовательность (5¢ - 3 ¢ )

Локализация внутри гена

Размер амплифицированного продукта

GGTTATCAATGTTGCGGGTGG

349 - 368

CGGCACTTTTTTCTCTTCGG

431 - 450

GTATGGTGGTGTAACTGAGC

666 - 685

CCAAATAGTGACGAGTTAGG

810 - 829

AGATGAAGTAGTTGATGTGTAT

432 - 455

CACACTTTTAGAATCAACCG

863 - 882

ACCCCTGTTCCCTTATCAATC

88 - 107

TTTTCAGTATTTGTAACGCC

394 - 413

. Организация эпидемиологического надзора за внутрибольничными инфекциями, вызванными MRSA

Эпидемиологический надзор за MRSA является составной частью эпидемиологического надзора за ВБИ и включает следующие составные элементы:

Выявление, учет и регистрацию всех случаев ВБИ, вызванных MRSA и подтвержденных результатами микробиологических исследований;

Выявление пациентов, колонизованных MRSA (по эпидемическим показаниям);

Определение спектра устойчивости изолятов MRSA к антибиотикам, антисептикам, дезинфектантам и чувствительности к бактериофагам;

Контроль за состоянием здоровья медицинского персонала (носительством эпидемически значимых штаммов, заболеваемостью);

Санитарно-бактериологические исследования объектов окружающей среды на наличие MRSA ;

Проведение молекулярно-генетического мониторинга, целью которого является получение данных о структуре госпитальных изолятов, выявлении среди них эпидемически значимых, а также расшифровка механизмов их циркуляции и распространения в стационаре;

Слежение за соблюдением санитарно-гигиенического и противоэпидемического режима;

Эпидемиологический анализ заболеваемости и смертности от ВБИ, позволяющий сделать заключение об источниках, путях и факторах передачи, а также условиях, способствующих инфицированию.

Центральным звеном эпидемиологического анализа должен являться молекулярно-генетический мониторинг. Основанный на его данных эпидемиологический анализ не только позволит правильно оценивать, но и прогнозировать эпидемические ситуации, посредством заблаговременных противоэпидемических мероприятий предотвращать вспышки ВБИ, вызванные MRSA .

Организационно-методическое руководство работой по профилактике и борьбе с ВБИ, вызванными MRSA , осуществляют структурные подразделения органов и учреждений, осуществляющих государственный санитарно-эпидемиологический надзор в республиках, краях, областях, округах и г.г. Москве и Санкт-Петербурге.

Федеральные органы исполнительной власти, включая органы управления здравоохранением, участвуют в осуществлении комплекса мероприятий по профилактике ВБИ, в т.ч. обусловленных MRSA .

Многие бактериальные инфекции протекают скрыто и имеют стертую клиническую картину , поэтому анализы являются необходимой частью выявления таких заболеваний. С эпидемиологической точки зрения носительство является основополагающим в распространении инфекции, важно своевременно диагностировать его и предупредить заражение. Особенно опасны работники лечебных и детских учреждений, родильных домов, пищеблоков, отделений для новорожденных. Одной из таких бактерий является стафилококк. Рассмотрим в этой статье, как и где сдать анализ на стафилококк и что для этого необходимо.

Основным методом диагностики стафилококка является бактериологический посев отделяемого на культуральные среды, с определением чувствительности микроорганизма к антибиотикам.

Анализ крови на стафилококк проводится методом, выявляющим антитела к антигену бактерии в сыворотке. Применяют реакцию пассивной гемагглютинации и иммуноферментный анализ. Однократные серологические исследования крови на стафилококк не представляют диагностической ценности. Важным является нарастание титра антител при исследовании парных сывороток через 7-10 дней. Выявление антител применяют при гнойно-септических процессах, спровоцированных золотистым стафилококком (сепсис, флегмона, абсцессы, фурункулы, отравления, перитонит, ангина).

Также существует ПЦР на стафилококк в крови, при котором определяют ДНК возбудителя.

Серологические анализы и ПЦР являются дополнением к бактериологическому исследованию.

Информация о возбудителе

Стафилококк представляет собой грамположительную бактерию сферической формы , неподвижную, факультативно-анаэробную, располагающуюся в мазке в виде «гроздьев винограда» и имеющую фермент каталазу. Выделяется до 30 видов этой бактерии. Она может населять слизистые и кожу, не вызывая нарушения, но есть виды, которые чрезвычайно опасны для здоровья и могут вызвать воспалительные заболевания. Выделяют три основных типа патогенных микроорганизмов:

  • стафилококк сапрофитный (S.saprophyticus). Чаще наблюдается у женщин, чем у мужчин. Обитает в мочевыводящей и половой системе. Может вызывать уретрит и цистит.
  • стафилококк эпидермальный (S.epidermidis). Располагается на коже, может в норме присутствовать в незначительных количествах. При нарушении кожного покрова и снижении иммунитета проникает в кровоток, вызывая патологические процессы, такие как: эндокардит, сепсис, конъюнктивит, инфекцию ран и мочевыводящих путей. Первые два вида длительно считались непатогенными, так как являются коагулазоотрицательными, но потом эту точку зрения опровергли.
  • стафилококк золотистый (S.aureus). Является самым патогенным из трех видов. Может вызывать различные заболевания, протекающие в локализованных и генерализованных формах с поражением различных органов и кожи. Вырабатывает пигмент-каротиноид и выделяет энтеротоксины типа А и В.
Золотистый стафилококк чрезвычайно устойчив в окружающей среде, выдерживает прямые солнечные лучи до 12 часов, температуру 150 градусов в течение десяти минут, не боится перекиси водорода, этилового спирта и хлорида натрия.

Передача бактерии происходит различными путями :

  1. воздушно-капельный (при разговоре, чихании, кашле);
  2. контактно-бытовой (руки, белье, предметы ухода, перевязочные материалы);
  3. пищевой (продукты питания, молоко);
  4. эндогенный (при иммунодефиците);
  5. парентеральный (при медицинских манипуляциях).
Источником инфекции являются больные и «здоровые» бактерионосители .

Посмотрите видео на эту тему

Показания

  1. подозрение на инфекцию или бактерионосительство.
  2. регулярный плановый медицинский осмотр медицинского персонала и работников общепита (работники родильных домов обследуются 1 раз в полгода, хирургических отделений 1 раз в квартал).
  3. обследование перед госпитализацией (для профилактики внутрибольничных инфекций).
  4. беременность.
  5. профилактическое обследование.
  6. неспецифические воспалительные заболевания инфекционной природы.
Наиболее подвержены риску заражения новорожденные, пожилые люди и грудные дети.

Также в зоне риска находятся лица с иммунодефицитом (ВИЧ-инфекция), наркоманы, люди, страдающие острыми вирусными заболеваниями (грипп, гепатиты), сахарным диабетом, онкологическими заболеваниями, имеющие ожоги и травмы, проходящие лечение кортикостероидами и цитостатиками, пациенты на гемодиализе.

Как сдать анализ

Для серологического берут венозную кровь из области локтевого сгиба, в пробирку с гелем, содержащим активатор свертывания. Далее в лаборатории ее центрифугируют для отделения сыворотки, которую в дальнейшем исследуют на наличие антител. Кровь сдавать только утром, натощак.

Для полимеразной цепной реакции берут венозную кровь в пробирку с антикоагулянтом, исследуют методом увеличения концентрации нуклеиновой кислоты многократным копированием участка ДНК.

Для бактериологического анализа обычно берут мазок из зева и носа.

Также могут использоваться другие биологические материалы: мокрота, грудное молоко, моча, кал, материал с раневой поверхности, урогенитальный мазок.

Мазок из зева и носа берется с утра, одним стерильным ватным тампоном берут сначала из носа, другим из зева, затем их помещают в пробирки, содержащие транспортный раствор.

Если вы нашли ошибку, пожалуйста, выделите фрагмент текста и нажмите Ctrl+Enter.